Los inicios del Club Deportivo Cuenca se dieron cuando los cuencanos Alejandro Serrano Aguilar (alcalde de la ciudad), Polibio Vásquez Astudillo y Alfredo Peña Calderón, asistieron al Mundial de México 1970. Motivados por lo que presenciaron en la cita máxima del balompié, se comprometieron en hacer realidad un sueño: tener un equipo profesional que represente a Cuenca en el Campeonato Ecuatoriano de Fútbol.

El 4 de marzo de 1971, se convocó a una sesión en el salón de la ciudad, a aquellas personas que querían que el fútbol profesional fuera parte de la provincia del Azuay y allí se consolidó de manera oficial el Club Deportivo Cuenca.