Luego del triunfo 5-1 ante CS Emelec, en el cotejo disputado en Cuenca por la décima fecha del Hexagonal 2, Deportivo Cuenca alcanzó la clasificación a la fase previa de la Copa Sudamericana 2026, al acumular 59 puntos y una diferencia de gol de +10.

El equipo dirigido por el profesor Norberto Araujo se ubicó en el segundo puesto del Hexagonal 2, por detrás de Macará, que sumó 62 puntos.

La campaña del 2025 fue la siguiente: 40 partidos jugados, 17 triunfos, 8 empates y 15 derrotas, con 51 goles a favor y 41 en contra.

En condición de local, el equipo disputó 20 partidos, con 9 victorias, 4 empates y 7 derrotas. Mientras que de visitante logró 8 triunfos, 4 empates y 8 derrotas.

De esta manera, el club consiguió su sexta clasificación a la Copa Sudamericana, siendo su mejor participación la de 2018, cuando alcanzó los octavos de final y enfrentó a Fluminense.